EVENTO
Priorização de alvos moleculares em bactérias patogênicas através da integração de dados transcritômicos aplicados à reconstrução metabólica
Tipo de evento: Seminário de Avaliação - Série A
A emergência de isolados clínicos bacterianos apresentando resistência a uma ampla gama de medicamentos antibióticos representa uma preocupação global. Embora bactérias resistentes a alguns antibióticos já tenham sido relatadas na literatura médica desde o princípio do uso destas substâncias, no início do século XX, atualmente enfrentamos bactérias ditas pan-resistentes com capacidade de evadir à ação de todas as classes de drogas hoje disponíveis. O melhor entendimento dos mecanismos de resistência e virulência, bem como o delineamento de novas estratégias para o desenvolvimento de opções terapêuticas alternativas torna-se, portanto, imperativo. A presente proposta de tese de doutoramento tem como objeto de estudo central a bactéria Klebsiella pneumoniae Kp13, isolada no Sul do Brasil em 2009 na ocasião de um surto clonal e cujo genoma foi completamente determinado por nosso grupo. Esta cepa possui resistência multi-droga incluindo polimixina B (MIC > 32 mg/L), antibiótico considerado de último recurso no tratamento de patógenos Gram-negativos multiresistentes. Utilizando técnicas de distintos ramos, notadamente bioinformática, a transcritômica (RNA-seq), a biologia de sistemas e a modelagem molecular, busca-se maior entendimento da resposta da ativação/desativação gênica de K. pneumoniae frente a variações do meio e a exposição à polimixina B, e como estes influenciam no repertório metabólico exibido por esta bactéria. Ademais, objetiva-se determinar um subconjunto de proteínas que possam servir como novos alvos terapêuticos para o controle deste importante patógeno, utilizando uma estratégia que integra os dados de expressão, metabólicos e da reconstrução estrutural do proteoma desta bactéria. Em paralelo, esta estratégia foi também aplicada ao estudo de Mycobacterium tuberculosis H37Rv (Mtb), a cepa mais bem caracterizada desta bactéria. Foi dado um foco no complemento metabólico de Mtb, realizando a reconstrução de vias metabólicas importantes ao seu crescimento, correlacionando-as com alvos proteicos do ponto de vista estrutural (Defelipe L.A.; Porto, D.F. ; Ramos Pereira P.I.; Nicolás, M.F., Turjanski A. et al. A Whole genome bioinformatic approach to determine potential latent phase specific targets in Mycobacterium tuberculosis. Tuberculosis (Edinburgh), 2015 In press). Sendo assim, serão apresentados os principais resultados obtidos até o momento do estudo destes importantes patógenos bacterianos, enfatizando a resposta regulatória dos estudos de expressão em K. pneumoniae Kp13 e como estes jogam luz aos mecanismos envolvidos na resistência à polimixina, bem como no complemento metabólico de Mtb e sua interseção com proteínas que possam servir como alvos para novos fármacos.
Data Início: 27/01/2016 Hora: 14:00 Data Fim: 27/01/2016 Hora: 17:00
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Sala 01 - Pós-Graduação
Aluno: Pablo Ivan Ramos - Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz-Bahia
Orientador: Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC
Participante Banca Examinadora: Laurent Emmanuel Dardenne - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Marisa Fabiana Nicolás - Laboratório Nacional de Computação Científica - LNCC Paulo Mascarello Bisch - Universidade Federal do Rio de Janeiro - IBCCF/UFRJ
